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loading buffer

loading 缓冲器的中文名字叫上样缓冲液,6*的缓冲液中可以显示两条带,前面的白及色的条带是溴酚蓝,在0.6%、1%、1.4%和2%琼脂糖凝胶电泳中,溴酚兰的迁移率分别与1Kb、0.6Kb、0.2Kb和0.15Kb的双链线性脱氧核糖核酸片段大致相同;后面的蓝色条带是二甲苯,它在1%和1.4%琼脂糖中电泳时,其迁移速率分别与2Kb和1.6Kb的双链线性DNA大致相似。而对于PAGE胶他们的迁移速率也分别不同。

主要用途

loading 缓冲器的功能主要有两个。第一,里边的指示剂对溴苯酚蓝和二甲苯氰FF起到指示的作用,显示电泳的进程,以便我们适时终止电泳;第二,里边的成分丙三醇可以加大样品密度,使样品密度大于TAE,从而沉降到点样孔中,防止样品飘出点样孔。另外,有的Buffer是加有SDS的,一般都会写明。SDS主要是促使聚合酶变性,因为没有除尽的聚合酶会结合在脱氧核糖核酸双链上影响它的迁移速率细胞裂解后的裂解液,加loading 100℃加热,也是为了中止酶促反应,防止提取的蛋白质降解。

制备方法

6×loading 缓冲器 一般配置:

6×Loading buffer:

30mM 乙二胺四乙酸二钠

36%(v/v) 丙三醇

0.05%(w/v) Xylene Cyanol FF

0.05%(w/v) Bromophenol 蓝色

主要用于DNA电泳

10×Loading buffer:

30mM EDTA

50%(v/v) Glycerol

0.25%(w/v) Xylene Cyanol FF

0.25%(w/v) Bromophenol Blue

主要用于核糖核酸电泳

10 X loading buffer中仅有色素溴酚蓝(Bromophenol Blue)一种染料(浓度0.05%);

6 X loading buffer中含色素溴酚蓝(Bromophenol 蓝色)、二甲苯蓝FF(Xylene Cyanol FF)两种染料(浓度都是0.05%)

琼脂糖凝胶(0.5% ~ 1.4%)中溴酚蓝(Bromophenol Blue)约与300 bp的双链线状脱氧核糖核酸的迁移速度相同,二甲苯腈蓝FF则与4 kbp的双链线状DNA的迁移速度相等

6Xloading 缓冲器是用来上样的;10Xloading buffer是stop buffer,是停止酶促反应的,如果一定要用10Xloading buffer的上样当然也可以,唯一要注意的是:10Xloading buffer中多了一样SDS,它会使酶类如taq酶变性,以PCR产物为例,在电泳泳道上会产生一片弥散,如果电泳跑的距离短,和多出来一条带没有什么区别(大概1000bp左右)。

5×SDS-PAGE Loading Buffer配制方法

组份浓度:

250mM 乙酰丙酮铁HCl(pH6.8)

10%(W/V) SDS

0.5%(W/V) BPB

50%(V/V)丙三醇

5%(W/V) β-2-巯基乙醇

配制量: 5mL

配制方法:

1.量取下列试剂,置于10mL塑料离心管中。

1M Tris-HCl  1.25mL

SDS  0.5g

BPB  25mg

甘油  2.5mL

2.加入纯水溶解后定容至5mL。

3.小份(500μl/份)分装后,于室温保存。

4.使用前将25μl的2-ME加到每小份中。

5.加入2-ME的Loading 缓冲器可在室温下保存一个月左右。

参考资料