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徐讯

徐讯,博士,研究员。深圳华大生命科学院研究院院长、中国科学院大学博士生导师。担任国际化标准组织ISO/TC276副主席。 ISBER(国际生物及环境样本库协会)中国区主席。全国生物样本标准化技术委员会SAC/TC559委员。

徐讯2007年本科毕业于武汉大学生物学,2015年博士毕业于中国科学院昆明动物研究所。目前在单细胞、基因测序技术、基因组研究等领域发表两百余篇国际顶级科学期刊研究论文,近五年引用次数达24000余次,连续七年入选科睿唯安信息服务(北京)有限公司“高被引科学家”。主持或参与多项重大项目,包括国家863测序仪项目、发改委产业集聚项目等。曾荣获“科技部大挑战青年科学家”、“鹏城杰出人才奖”、“广东省科学技术奖”一等奖、 “教育部自然科学奖二等奖,入选国家百千万人才工程“有突出贡献中青年专家”、广东省和深圳市“最美科技工作者”。 自2018年至今,徐讯连任两届国际标准化组织/生物技术委员会副主席(ISO/TC276),推动中国主导的10项国际标准的快速进展,以及3项标准新提案,对我国实现引领生物技术领域的国际标准化具有重大意义。

人物经历

2007年,徐讯加入华大。

2010-2012年,通过多个典型家养动植物模型揭示了人工选择下家养动植物基因组变异的一般规律。其中玉蜀黍属相关的研究成果以两篇封面文章发表在《自然-遗传学》上,水稻、谷子的研究成果均发表在《自然-生物技术》上。大豆基因组研究成果以封面文章形式发表在《Nature genetics》上,并于2016年获教育部自然科学二等奖

2012年,徐讯带领华大团队在全球首次实现实体肿瘤单细胞基因组测序,构建癌细胞克隆演化的系统发生树,在单细胞层次揭示了肿瘤演化过程的复杂性,鉴定了原发癌症发生发展起到重要作用的细胞异质性亚群和关键基因,成果发表于《细胞》,并被《基因组研究》评价为单细胞测序在肿瘤领域应用的里程碑式成果。

徐讯作为深圳华大基因研究院院长,建立并带领团队完成了具有自主产权、具有国际领先水平的国产高通量基因组测序系统。其带领的华大基因研究院团队在基础科研上保持了高水平的科研成果,增加了深圳市科研名片的含金量,同时不断推动了基因组技术在出生缺陷、精准医学、农业等各方面的产业应用。参与多项科技部973项目,863项目,农业部948项目,曾主持国家国家高技术研究发展计划国产测序仪项目课题和发改委产业集聚项目课题。

2013年以徐讯为组长的华大基因CG重组工作领导小组,代表华大基因完成了对美国上市公司Complete Genomics的整体收购。收购CG后,华大建立了高通量测序仪研发团队,开发出具有完全自主知识产权的基因测序仪,打破了高端测序技术长期依赖进口的局面,填补了国产可商用测序仪的空白。

2014年,徐讯主持国家863计划“新一代基因测序仪及配套产品研发”项目,攻克样本制备、信号检测、生化测序、数据分析等关键技术,研制出有完全自主知识产权的第二代高通量测序系统及配套试剂。在准确度、通量、性价比等方面实现对标国际先进水平,打破了国外技术垄断,是实现核心技术自立自强的全新突破。

2015年起,徐讯担任深圳华大基因研究院院长。

2015—2018年间,徐讯担任深圳国家基因库执行主任,负责深圳国家基因库一期的建设和运营。

2018年,徐讯带领团队开展的人类群体进化基因组研究,首次基于超十万例样本阐释了中国人群的遗传结构特征,为人群适应性提供了基因组机制参考,相关成果发表于《细胞》上。这是迄今为止最大规模的中国人基因组学大数据研究成果,被Prenatal Diagnosis编辑点评为2018年产前诊断领域最卓越的科学进展之一。

2021年,徐讯随“奋斗者”号载人潜水器下潜至万米深渊,在马里亚纳海沟“挑战者深渊”最深区域进行科考作业。航次期间,他与其他参航科学家共同宣布启动“马里亚纳海沟生态环境科研计划”。该计划邀请国内外研究学者协力攻坚深海地球科学系统的形成与演化、生命起源与环境适应、生物多样性与气候变化等重大科学问题。

2022年4月,徐讯带领团队基于华大自主开发的单细胞微流控系统DNBelab C4,联合多国科研团队于《自然》上期刊发布了全球首个非人灵长目全细胞图谱,并在此基础上构建了包含新冠、乙肝、狂犬病毒等126种病毒易感细胞类型的病毒数据库。

2022年5月,徐讯带领团队基于华大自主研发的时空组学Stereo-seq技术,联合多家机构实现了首批生命全景地图的绘制,并以专题形式发布于Cell Press官网,其中包括四种模式生物胚胎发育或器官的时空图谱,首次从时间和空间维度对生命发育过程中的基因和细胞变化进行了解析,开启了生命研究新领域。

2022年5月,华大等机构领衔、来自16个国家的80多位科学家共同参与的时空组学联盟(STOC)宣布成立。对于该联盟的成立,《自然》杂志的评论文章《MAPPING MESSAGES AT CELLULAR SCALE》称之有望提升时空组学领域科研合作和数据共享水平的进展。

社会职务

获得荣誉

主要论文

1. J. Lai ,…, X. Xu*, et al.,Genome-wide patterns of genetic variation among elite maize inbred lines. Nature Genetics 42(11):1027-30 (2010).

2. H. Lam , X. Xu*, et al.,Resequencing of 31 wild and cultivated soybean genomes identifies patterns of genetic diversity and selection. Nature Genetics 42(12):1053-9(2010).

3. X. Xu*, et al., Genome sequence and analysis of the tuber crop 阳芋 Nature. 475(7355):189-95 (2011).

4. X. Xu*, et al., Single-Cell Exome Sequencing Reveals Single-Nucleotide Mutation. Cell 148,886-895(2012)

5. G. Zhang,…, X. Xu*, et al., Genome sequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grass evolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30(6):549-54 (2012).

6. M. B Hufford, X. Xu*, et al., Comparative 种群 genomics of maize domestication and improvement. Nat Genet 44(7):808-11(2012).

7. Dong Y, … X. Xu#, et al., Sequencing and automated whole-genome optical mapping of the genome of a domestic goat (Capra hircus). Nat Biotechnol 31(2):135-41(2013).

8. Y. Jiang, …, X. Xu#, et al., The sheep genome illuminates biology of the rumen and lipid metabolism. Science 344(6188): 1168-73 (2014).

9. Z. Hu, …,X. Xu#, et al. Genome-wide profiling of 人类乳头瘤病毒 integration in cervical cancer identifies clustered genomic hot spots and a potential microhomology-mediated integration mechanism. Nature Genetics (47)158–163 (2015).

10. R. Varshney, …X. Xu#. Pearl millet genome sequence provides a resource to improve agronomic traits in arid environments. Nature Biotechnology (35) 969–976 (2017).

11.S. Liu , …, X. Xu#. Genomic Analyses from Non-invasive Prenatal Testing Reveal Genetic Associations, Patterns of Viral Infections, and Chinese Population History. 细胞 175, 347-359 (2018).

12.R. Varshney, …,X. Xu#, et al. Resequencing of 429 chickpea accessions from 45 countries provides insights into genome diversity, domestication and agronomic traits. Nat Genet. 51(5):857-864 (2019).

13. L. Han, … X. Xu#, et al. Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis. Nature. 604,723-731(2022)

14.A. Chen, …, X. Xu#, et al. Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using 脱氧核糖核酸 nanoball-patterned arrays. Cell. 185(10),1777-1792 .e21(2022)

社会活动

2019年7月1日,由新浪财经和正和岛联手主办的2019夏季达沃斯新浪财经之夜·正和岛夜话在大连市举行,主题为《全球化4.0时代的中国创新》,中国华大集成电路设计集团有限公司首席执行官、华大研究院院长徐讯出席并演讲。他谈到,生命科技需要创新,更需要合规和社会责任。

2021年5月19日,南开大学生命科学学院院长陈与深圳华大基因科技有限公司CEO、深圳华大基因研究院院长徐讯代表双方签署合作协议。

参考资料

南开大学牵手华大 共建联合研究中心 —.中国教育在线.2021-05-21